El equipo dirigido por Unai Emery logró disputar cada temporada la Liga de Campeones, mientras el club incorporaba futbolistas jóvenes o poco conocidos que hacían disminuir el nivel de la plantilla. Durante la temporada 1999/2000, el equipo estuvo a punto de lograr el ascenso. Se aseguró que habría una segunda fase de venta de acciones para democratizar el club pero nunca llegó a realizarse.